Доброе утро! Или база должна быть у вас на компьютере, или периодически просите копию базы. Контролировать сдачу отчетов сложнее, если вы далеки от этого. Придется изучить, какие отчеты должна сдавать ваша компания, и в какие сроки, и требовать от бухгалтера предоставлять вам эти отчеты с отметкой принимающего органа, или квитанцией о приеме, если сдача через электронку. Периодически делайте сверку с налоговой, это вы можете делать самостоятельно.